يتم احتساب ضريبة المرتبات والأجور سنويا وذلك بعد تحويل المرتب والأجر الشهري إلي سنوي ويشمل الأجر أو المرتب كل ما يتقاضاه الموظف أو العامل تحت أي مسمي ويتم استقطاع كافة الاستقطاعات والتي تتمثل في الإعفاء الشخصي والذي يحسب بواقع ٢٠٠٠٠ جنية سنويا وحصة العامل في التأمينات الاجتماعية وكذلك خصم العامل في صناديق التأمين الخاصة وأقساط التأمين لمصلحته أو أولادة القصر بشرط ألا يزيد كل من الاشتراك في صناديق التأمين الخاصة وأقساط التأمين لمصلحته أو زوجته أو أولادة القصر عن ١٥٪ من صافي الدخل أو ١٠٠٠٠ أيهما أقل ويتم تطبيق أسعار الضريبة التي تبدأ من ١٠٪ بعد الشريحة الصفرية وقدرها ٤٠٠٠ جنيه.